在淀粉廢水處理工程當中，由于淀粉廢水排放量大，有機負荷高，污染嚴重，且處理難度大，以上所列舉的淀粉廢水處理方法在實際中都有應用，但也都存在一些問題。

1）淀粉廢水處理的絮凝沉淀法，雖具有基建投資少、工藝簡單、操作容易、能耗低、對氣溫的變化適應性強.但絮凝沉淀法去除效率較低，尤其是對廢水中小分子有機物的去除率更低，往往需要和其它處理方法結合使用，廢水才能達標排放。

2）淀粉廢水處理的氣浮法，雖具有分離時間短、裝置簡單、處理量大、占地面積小等優點.但氣浮法的處理效率與進料位置、進氣量、液面高度、氣浮劑用量等操作條件密切相關，操作管理復雜，同時對處理設備性能要求較高，投資費用和運行費用都較高。

3）淀粉廢水處理的生物法，具有技術成熟可靠、耐沖擊能力強、處理效果好，尤其以UASB反應器為主體的厭氧生物處理工藝在降解污染物的同時還能回收能源甲烷氣，在淀粉廢水處理中得到了廣泛應用.但生物處理法占地面積大，能耗大，投資費用和運行費用高，受廢水的水溫、pH、有毒物質等環境條件影響較大。

4）淀粉廢水處理的光合細菌法，具有機污染物去除率高，投資省，占地少，且菌體污泥是對人畜無害、富含營養的蛋白飼料，是一種非常有前途的凈化高濃度有機廢水的處理技術.但光合細菌法對溫度變化敏感，需要相應的加熱和保溫裝置，晚上需要較強的白織燈光照，運行費用較高，管理不便等。

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