由于乳制品廢水具有可生化性好、易生物降解的特點，基本上各種生物處理工藝都適于此類廢水的處理。針對某一具體的乳制品工業污水處理，各工藝單元的選用，則需根據水質特點、施工條件、排放要求、自動化程度等多方面綜合考慮后確定。

含油脂較多的乳制品廢水，易氣浮分離，渦凹氣浮即可滿足使用要求，與溶氣氣浮系統相比，渦凹氣浮設備簡單、費用少、占地面積小。但溶氣氣浮氣泡更細小，更適于處理懸浮物少、乳化程度高的乳制品廢水。

由于乳制品廢水有機物濃度較高，氮磷相對缺乏，采用傳統活性污泥法處理工藝時，易因營養物缺乏而發生污泥膨脹現象，造成污泥流失、水質惡化，影響出水水質，嚴重時甚至會導致工藝無法正常運行，因此應選擇可有效防止污泥膨脹的工藝。常用于乳制品廢水處理的好氧工藝有：SASS工藝（帶選擇器的活性污泥法）、CASS工藝（循環式活性污泥法）、SBR法、生物接觸氧化法、氧化溝等。這些工藝并沒有本質上的差別，都能較好地實現去除有機物的目的。以除C為目標時，選擇帶有選擇器的活性污泥法工藝，運行操作較簡單；自動化程度高，有脫氮、除磷要求時，可選用SBR或氧化溝工藝；當場地受限時，可選用生物接觸氧化和BAF（曝氣生物濾池）工藝。選用BAF工藝時，需控制好前一級單元出水的SS，如采用“厭氧＋氣?。獴AF”工藝流程。BAF還可作為好氧后的深度處理單元，出水回用于廠區。

乳制品廢水的厭氧工藝采用常溫消化即可，厭氧濾池因其生物量大，比UASB對溫度的要求更低，但同BAF一樣存在易堵塞的問題，要控制進水SS不超過200mg/L。從污染物濃度、種類而言，厭氧工藝適合處理乳制品廢水，但乳脂的厭氧消化所需時間要長于乳蛋白、乳糖所需的消化時間，其限制步驟是水解。因此對于乳制品廢水處理，可在厭氧單元前增設水解單元，延長乳脂的水解時間，有利于提高后續厭氧池的處理效率及穩定運行。

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