工業廢水處理中，微生物絮凝劑主要是通過微生物培養、發酵、提取、精制后的一種產物，由于生產制作來源于微生物體，這種絮凝劑安全性較高、無毒無害，能夠解決其他絮凝劑不可二次回收利用、污泥處置費高等問題。

其他非微生物絮凝劑根據成分分類，主要分為無機絮凝劑以及有機高分子絮凝劑。非微生物絮凝劑多數含有金屬離子，產生的絮凝體含有大量金屬鹽，與微生物絮凝劑由多聚糖類等成分組成的無害特性相比，這種含金屬鹽絮凝體脫水后形成的污泥一是會產生二次污染，污染環境，二是需要外運處理，會造成污泥處置費用的產生，給企業增加運行成本；這對于一些食品廠的資源回收利用來說是個問題，既要找到一種有效分離出資源的方法，又要求綠色無毒害，這就發展出了微生物絮凝劑。

例如豆制品廢水中大量豆渣，通常是以不溶性的固體懸浮物存在，在經過腐敗后形成溶解性有機物前，可利用微生物絮凝劑將這些固體物質分離出來，經過分離處理產生的泥渣對人體和動物無任何危害，可以進行回收利用，用于制作飼料、肥料等等，這些廢水的有機物的含量較高，回收價值也較高；經過回收之后的資源得到利用、產生經濟價值，同時又能夠降低廢水污染物濃度，減少廢水處理運行成本。

在水處理中，雖然絮凝劑會帶入新的污染，但是微生物絮凝劑的成分具有可生化性，不含金屬離子以及一些難降解分子，不會對廢水處理增加難度。再者其絮凝效果較好，速率大，種類多，轉換的能力強，而且生長繁殖以較快，生長周期短。從處理能力上看，微生物絮凝劑也具有其他非生物絮凝劑的特點，可去除廢水中的有機物、進行脫色、進行油水分離。

另外，若廢水中含有有毒物質時，其處理效率就會受到干擾和影響，并且用量較大，成本也較高。所以，微生物絮凝劑的使用還是要根據實際水質來決定是否使用，建議尋找專業的環保公司進行檢測。

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