畜禽工業污水處理的厭氧生物處理，也稱厭氧消化或沼氣發酵，厭氧生物處理是在無分子氧的條件下，通過兼性厭氧微生物、厭氧微生物的作用，將廢水中各種復雜有機物分解轉化成甲烷和二氧化碳等物質的過程。畜禽糞水有機物濃度高，并且碳、氮的比例適中，厭氧處理產氣性能比較穩定。通常將畜禽糞水處理與可再生能源開發結合起來，因此，畜禽糞水處理厭氧處理工程常常是沼氣工程。

(1)溫度：溫度對厭氧微生物的影響尤為顯著。厭氧微生物可分為嗜熱菌 (或高菌)、嗜溫菌(中溫菌)；相應地，厭氧消化分為：高溫消化(55℃左右)和中溫消化(35℃左右)；高溫消化的反成速率約為中溫消化的1.5-1.9倍，產氣率也較高，但氣體中甲烷含量較低。當處理含有病原菌和寄生蟲卵的廢水時，高溫消化可取得較好的衛生效果，消化后污泥的脫水性能也較好。

(2)pH值：pH值是厭氧消化過程中重要的影響因素。產甲烷菌對pH值的變化非常敏感，一般認為，其適宜pH值范圍為6.8-7.2，在<6.5或>8.2時，產甲烷菌受到嚴重抑制，導致整個厭氧消化過程的惡化。

(3)氧化還原電位：嚴格的厭氧環境是產甲烷菌進行正常生理活動的基本條件。非產甲烷菌可以在氧化還原電位為+100--100毫伏的環境正常生長和活動。而產甲烷菌的適宜氧化還原電位為-150--400毫伏，在培養產甲烷菌的初期，氧化還原電位不能高于-330毫伏。

(4)營養要求：厭氧微生物對N、P等營養物質的要求略低于好氧微生物，要求COD:N:P=200:5:1。多數厭氧菌不具有合成某些必要的維生素或氨基酸的功能，必要時需要投加Ni、Co、Mo、Fe等微量元素。

(5)F/M：厭氧生物處理的有機物負荷較好氧生物處理更高，一般可達5-10千克COD/(立方米·天)，甚至可達50-80千克 COD/ (立方米·天)。無傳氧的限制，可以積聚更高的生物量，但是產酸階段的反應速率遠高于產甲烷階段。因此，必須十分謹慎地選擇有機負荷。

(6)有毒物質：常見的有毒物質有硫化物、氨氮、重金屬、氰化物等有機物。

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