制藥廢水處理技術可歸納為以下幾種：生物處理法、化學處理法、物理化學處理法、物理處理法等四種，各種處理方法具有各自的優勢及不足。

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1、生物處理技術

生物處理技術是一般有機廢水處理系統中重要的過程之一，是利用微生物，主要是細菌的代謝作用，氧化、分解、吸附廢水中可溶性的有機物及部分不溶性有機物，并使其轉化為無害的穩定物質從而使水得凈化的技術。在現代的生物技術處理過程中，主要有好氧生物氧化、兼氧生物降解及厭氧消化降解被廣泛應用，生物處理技術由于經濟可行、無二次污染等特點，已越來越引起重視。

2、化學處理技術

化學處理技術是應用化學原理和化學作用將廢水中的污染物成分轉化為無害物質，使廢水到凈化的方法，其單元操作過程有中和、沉淀、氧化還原、催化氧化和焚燒等。

3、物理化學處理技術

物理化學處理技術是指廢水中的污染物在處理過程中通過相轉移的變化而達到去除目的的處理技術，常用的單元操作有萃取、吸附、膜技術、離子交換等。

4、物理處理技術

物理處理技術是指應用物理作用來分離廢水中的溶解物質或乳濁物改變廢水成分的處理方法，如格柵（篩網）、沉淀(沉砂)、過濾、微濾、氣浮、離心(旋流)分離等單元操作，已成為廢水處理流程的基礎，目前已較為成熟。盡管以上處理技術經過一百多年的發展，至今已經比較成熟，但由于制藥廢水成分復雜、有機物含量高、毒性大、色度深和含鹽量高，且生化性很差、間歇排放，屬難處理的工業廢水。

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