制藥工業廢水主要包括抗生素生產廢水、合成藥物生產廢水、中成藥生產廢水以及各類制劑生產過程的洗滌水和沖洗廢水四大類。其廢水的特點是成分復雜、有機物含量高、毒性大、色度深和含鹽量高，特別是生化性很差，且間歇排放，工業污水處理屬難處理的廢水。隨著我國醫藥工業的發展，制藥廢水已逐漸成為重要的污染源之一，制藥廢水處理如何處理該類廢水是當今環境保護的一個難題。

推進制藥業清潔生產，提高原料的利用率以及中間產物和副產品的綜合回收率，通過改革工藝使污染在生產過程中得到減少或消除。由于某些制藥生產工藝的特殊性，其廢水中含有大量可回收利用的物質，對這類制藥廢水處理，應首先加強物料回收和綜合利用。針對其醫藥中間體廢水中含量高達5％～10％的銨鹽，采用固定刮板薄膜蒸發、濃縮、結晶、回收質量分數為30％左右的（NH₄）2SO₄、NH₄NO₃作肥料或回用，具有明顯經濟效益；某高科技制藥企業用吹脫法處理甲醛含量極高的生產廢水，甲醛氣體經回收后可配成福爾馬林試劑，亦可作為鍋爐熱源進行焚燒。通過回收甲醛使資源得到可持續利用，并且4～5年內可將該處理站的投資費用收回，實現了環境效益和經濟效益的統一。但一般來說，制藥廢水成分復雜，不易回收，且回收流程復雜，成本較高。因此，先進高效的制藥廢水處理技術是徹底解決污水問題的關鍵。

關于制藥廢水處理的研究已有不少報道，但由于制藥行業原料及工藝的多樣性，排放的廢水水質千差萬別，所以制藥廢水處理并沒有成熟統一的治理方法，具體選擇哪種工藝路線取決于廢水的性質。根據該廢水的特點，一般應通過預處理以提高廢水的可生化性并初步去除污染物，再結合生化處理。目前，開發經濟、有效的復合水處理單元是亟待解決的問題。同時，應加強清潔生產的研究，并在處理前期考慮廢水是否有回收利用的價值和適當的途徑，以達到經濟效益和環境效益的統一。

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