在工業污水處理中影響反硝化作用的主要因素有碳源、溶解氧、溫度、PH值和堿度。

碳源。反硝化細菌所能利用的碳源是多種多樣的，但從廢水生物處理生物脫角度分為三類，廢水中所含的有機碳源、外加碳源、內源碳源。廢水中各種有機基質可以作為反硝化過程中的電子供體，當廢水中有足夠的有機物質，就不必添加碳源。一般實際工程中應控制BOD/TN大于4:1，當廢水中碳源過低時，即BOD/TN小于于3:1時，需要另外投加碳源才能達到理想的去除效果。

溶解氧。氧的存在會印制硝酸鹽的還原，其原因主要為一方面阻止抑制硝酸鹽還原酶的形成，另一方面可作為電子受體，從而競爭性地阻礙了硝酸鹽的還原。所以對于生物反硝化系統都必須設立一個不充氧的缺氧池或缺氧區段，以便使硝酸鹽通過反硝化的途徑轉化成氣態氮。

溫度。反硝化菌對溫度變化雖不如硝化菌那樣敏感，但反硝化效果也會隨著溫度變化而變化。溫度越高，反硝化速率也就越高，在30-35℃時，反硝化速率增至頂峰。當低于15℃時，反硝化速率明顯降低，至5℃時，反硝化作用將趨于停止。因此，在冬季要保證脫氮效果，就必須提高生物膜量。

pH和堿度。反硝化細菌對PH值得變化不如硝化細菌敏感，在pH微6-9的范圍內，均能進行正常的生理代謝，但生物反硝化的理想pH值范圍為6.5-8.0.當pH值>7.3時反硝化的終產物為N₂，當pH值<7.3時反硝化終產物為n₂O_。由于反硝化細菌對pH范圍要求較寬，因為在生物脫氮工藝中，pH值控制的關鍵在于生物硝化，只要pH值變化不影響硝化的順利進行，則肯定不會反硝化；反之，當pH值變化對硝化產生較大的影響，使之不能順利進行時，不管pH值對反硝化是否影響，脫氮效果都不會理想。在生物反硝化工程中將每克NO3--N轉化為N2，約產生3.57g堿度，這樣可以補償生物硝化所消耗的堿度的一半左右。由此，本應該外加堿源才能順利進行硝化的污水，可以不再需要加堿。

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